01
公共数据库挖掘与靶点 / 适应症探索
TCGA、ICGC、GEO、CCLE 的 pan-cancer 表达特异性、通路、signature 与免疫浸润分析;Hi-C / HiChIP 3D 基因组把 GWAS 非编码变异定位到它真正调控的靶基因。
交付靶点 / 适应症证据包、发表级图表、可复现脚本
BIOMEDICAL DATA SCIENCE CONSULTING
肿瘤生物信息 · 统计建模 · 转化研究咨询。洛铭是您研发团队的外置数据科学部门:您带着研发问题来,我们交付能拿去开会、能放进 data room 的图表与结论。
WHO WE WORK WITH
THE PROBLEMS WE SOLVE
几个候选靶点要决定先推哪一个;或者靶点已定,下一个适应症选哪个。我们用 TCGA、ICGC、GEO、CCLE 等公开数据库,看靶点在哪些癌种中肿瘤表达高于正常组织、正常组织里的安全窗在哪里、与免疫浸润和预后有什么关系。这一步不需要您提供任何内部数据。
手上有 scRNA-seq、bulk RNA-seq、WES 或 ctDNA 数据,内部人手排不过来;或者 bulk 结果模棱两可——整块组织取平均,信号被其他细胞稀释。我们做多组学整合与单细胞层级分析,先交质控报告,再交细胞注释、亚群图谱和样本层级结果表。
立项评审、BD 谈判、投稿,都会被追问“这个数字从哪里来”。我们的统计分析与预测模型做交叉验证和外部验证,每个数字可回溯来源,代码随报告交付。
CORE CAPABILITIES
01
TCGA、ICGC、GEO、CCLE 的 pan-cancer 表达特异性、通路、signature 与免疫浸润分析;Hi-C / HiChIP 3D 基因组把 GWAS 非编码变异定位到它真正调控的靶基因。
交付靶点 / 适应症证据包、发表级图表、可复现脚本
03
生存分析、Logistic、GEE、GLM / Lasso;Random Forest、SVM 等机器学习方法,做交叉验证与外部验证。
交付统计分析计划、模型代码与验证、Nomogram / 风险分层工具
PRODUCT · EVIDENCE PACK
一份针对单个靶点的固定版式报告,回答“这个靶点在哪个适应症有机会,风险在哪里”。用于授权谈判、立项和适应症选择。
WORKFLOW
把研发问题翻译成可分析的假设。
AI 辅助扫描文献与数据库,由专家判断现有数据能否回答这个问题。
可复现流程,每个数字可回溯来源。
结果对应回机制与临床。
能拿去开会、进 data room 的图与结论。
HOW WE WORK
AI 是我们每天在用的工具:LLM / agent 辅助文献与临床试验数据库扫描、代码生成和报告生成。每个数字由计算生物学家复核,每个结论可回溯来源。
SELECTED COLLABORATION
IF 29.5 · JCR 2025以期刊正式公布为准
PLT012 人源化抗 CD36 抗体:释放肝癌与肝转移中的抗肿瘤免疫。研究整合 TCGA pan-cancer、CIBERSORT、scRNA-seq 与 GSEA 公开数据,结合临床前与人 HCC ex vivo 验证,支持 CD36 靶向免疫治疗的概念验证;与瑞士临床阶段客户共同署名。
EGFR 突变 NSCLC 联合治疗获益 Nomogram
ctDNA 新抗原动态监测,分子应答早于影像学
DATA SECURITY
远程接入,数据留在您的服务器。
启动前签署 NDA,参与项目的成员同等受约束。
结项后归还或销毁全部副本。
遵循人类遗传资源与数据安全相关法规;客户数据不进公共模型。
第一步是免费 30 分钟初步咨询。您把研发问题讲一遍,我们告诉您能不能做、怎么做、需要哪些数据;判断做不了,也会直接说明。