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LUMING洛铭BIOMEDICAL DATA SCIENCE CONSULTING

BIOMEDICAL DATA SCIENCE CONSULTING

从多组学数据,到可验证的研发决策

肿瘤生物信息 · 统计建模 · 转化研究咨询。洛铭是您研发团队的外置数据科学部门:您带着研发问题来,我们交付能拿去开会、能放进 data room 的图表与结论。

  • 中国 · 欧洲 · 台湾
  • 发现 → 验证 → 转化
  • 多组学 × 统计建模 × 机器学习
示意图:单细胞 UMAP 点云上叠加一张高、低风险两组的 Kaplan–Meier 生存曲线卡片,表示从多组学数据到可验证结论。非真实数据。
ILLUSTRATIVE · 分析产出示意,非真实客户数据

WHO WE WORK WITH

服务对象

  • 生物技术 / 制药企业:靶点评估、适应症选择、立项与 BD 材料。
  • CRO:项目中的生物信息分析与统计建模。
  • 医院 / 科研团队:临床样本数据分析、预测模型、论文与稿件支持。

THE PROBLEMS WE SOLVE

我们解决的问题

候选靶点要排序,适应症还没定

几个候选靶点要决定先推哪一个;或者靶点已定,下一个适应症选哪个。我们用 TCGA、ICGC、GEO、CCLE 等公开数据库,看靶点在哪些癌种中肿瘤表达高于正常组织、正常组织里的安全窗在哪里、与免疫浸润和预后有什么关系。这一步不需要您提供任何内部数据。

数据已经测了,结论还不清楚

手上有 scRNA-seq、bulk RNA-seq、WES 或 ctDNA 数据,内部人手排不过来;或者 bulk 结果模棱两可——整块组织取平均,信号被其他细胞稀释。我们做多组学整合与单细胞层级分析,先交质控报告,再交细胞注释、亚群图谱和样本层级结果表。

结论要经得起评审和审稿

立项评审、BD 谈判、投稿,都会被追问“这个数字从哪里来”。我们的统计分析与预测模型做交叉验证和外部验证,每个数字可回溯来源,代码随报告交付。

CORE CAPABILITIES

四大服务

01

公共数据库挖掘与靶点 / 适应症探索

TCGA、ICGC、GEO、CCLE 的 pan-cancer 表达特异性、通路、signature 与免疫浸润分析;Hi-C / HiChIP 3D 基因组把 GWAS 非编码变异定位到它真正调控的靶基因。

交付靶点 / 适应症证据包、发表级图表、可复现脚本

示意图:12 个 TCGA 癌种(BRCA、LUAD、LIHC、COAD、PAAD、KIRC、STAD、HNSC、OV、PRAD、SKCM、GBM)中某靶点在肿瘤与正常组织的表达箱型图,多数癌种肿瘤组织表达较高。非真实数据。

02

单细胞与多组学整合

scRNA-seq、bulk RNA-seq、WES、ctDNA;基因组、转录组、蛋白组与肿瘤微环境的整合分析。

交付细胞注释与亚群图谱、样本层级结果表、质控报告

示意图:单细胞 UMAP 散点图,上万个细胞分为 T 细胞、NK 细胞、B 细胞、髓系细胞、成纤维细胞、内皮细胞与两群恶性细胞共八个亚群。非真实数据。

03

统计分析与预测建模

生存分析、Logistic、GEE、GLM / Lasso;Random Forest、SVM 等机器学习方法,做交叉验证与外部验证。

交付统计分析计划、模型代码与验证、Nomogram / 风险分层工具

示意图:多因素生存分析森林图,列出年龄、分期、突变与 PS 评分的风险比及 95% 置信区间,参考线为 HR = 1。数值为示意。

04

临床前与转化研究支持

生物标志物、临床样本数据、抗体药物策略;in vivo / in vitro 实验设计与结果解读。

交付靶点评估报告、实验方案与样本量、论文与稿件支持

示意图:左侧为 24 个基因在 60 个样本中的表达热图,样本按风险分组;右侧为高、低风险两组的 Kaplan–Meier 生存曲线,高风险组生存较差,log-rank p 值标于图中。非真实数据。

PRODUCT · EVIDENCE PACK

靶点·适应症证据包

一份针对单个靶点的固定版式报告,回答“这个靶点在哪个适应症有机会,风险在哪里”。用于授权谈判、立项和适应症选择。

  • 零客户数据即可启动:全部基于公开数据库,不需要您的序列、实验数据或客户数据。
  • 每份 8–12 页,附可复现脚本。内容涵盖 pan-cancer 表达特异性、正常组织安全窗、免疫浸润关联、共表达与通路 signature、预后关联、单细胞层级细胞类型定位、临床试验与竞品现况扫描。
  • 交付时程约 4–6 周,依范围而定。
  • 试点从 3 个靶点起,版式与方法定下后可扩展到批量靶点。

证据包固定版式

三张报告页缩图:表达、单细胞、生存;每份 8–12 页。

示意图:靶点·适应症证据包的固定版式,三张报告页面缩图分别含表达箱型图、单细胞图与生存曲线,每份 8–12 页。
ILLUSTRATIVE · 分析产出示意,非真实客户数据

WORKFLOW

工作流程

了解我们的工作方法
  1. 01

    问题定义:

    把研发问题翻译成可分析的假设。

  2. 02

    数据评估:

    AI 辅助扫描文献与数据库,由专家判断现有数据能否回答这个问题。

  3. 03

    分析与验证:

    可复现流程,每个数字可回溯来源。

  4. 04

    生物学解读:

    结果对应回机制与临床。

  5. 05

    决策级交付:

    能拿去开会、进 data room 的图与结论。

HOW WE WORK

AI 加速 · 专家把关 · 全程可复现

AI 是我们每天在用的工具:LLM / agent 辅助文献与临床试验数据库扫描、代码生成和报告生成。每个数字由计算生物学家复核,每个结论可回溯来源。

我们不做的 AI

  • 不做黑箱预测。说不清依据的模型,我们不交付。
  • 不承诺“AI 发现靶点”。
  • 客户数据不进公共模型。

SELECTED COLLABORATION

代表性合作发表

查看全部发表

其他共同发表

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DATA SECURITY

数据安全四承诺

  • 数据不出境:

    远程接入,数据留在您的服务器。

  • 全程保密:

    启动前签署 NDA,参与项目的成员同等受约束。

  • 按约销毁:

    结项后归还或销毁全部副本。

  • 合规先行:

    遵循人类遗传资源与数据安全相关法规;客户数据不进公共模型。

让数据进入真正的研发决策

第一步是免费 30 分钟初步咨询。您把研发问题讲一遍,我们告诉您能不能做、怎么做、需要哪些数据;判断做不了,也会直接说明。

NMDD919@gmail.com